Simptomi koji su posljedica niskog nivoa estrogena najčešće se javljaju kod žena koje se približavaju ili su već ušle u menopauzu. I mlade žene mogu imati niske koncentracije estrogena, no simptomi i uzroci su drugačiji.
Najuobičajeniji simptom niskog nivoa estrogena kod mladih žena je izostanak menstruacije i zakašnjeli razvoj. Mlađe žene, mlađe od 40, s niskom koncentracijom estrogena mogu ući u ranu menopauzu, imati valunge i noćno znojenje. Umor je također često prisutan. Žene se žale i na zaboravnost, nesanicu, nedostatak seksualne želje te na bolne snošaje.
Neredovna menstruacija ili njen izostanak također su mogući. Dolazi i do promjena raspoloženja, plača, tuge i nervoze. Zbog mogućeg gubitka koštanog tkiva, može doći i do osteoporoze.
I neplodnost kod mlađih žena može ukazivati na nisku koncentraciju estrogena.