Sljedeći se alarm o dimu oglasio iz avionskog prostora ispod kokpita. Odmah nakon toga došlo je do naglog gubitka kontrole nad letjelicom i prestanka rada kompjuterskog sistema. Pojavila se tako i informacija da je na trupu aviona prije dvije godine bilo napisano na arapskom: “Srušit ćemo ovaj avion”.
Vlasti su, pak, to upozorenje povezivale s tada još uvijek nestabilnim stanjem u zemlji nakon što je vlast preuzeo general Abdel Fatah al-Sisi. Stoga je i dalje glavna teorija da je došlo do eksplozije u avionu. No, zašto niti jedna teroristička grupa nije preuzela odgovornost čime bi si podigla “ugled”?
Jedan bi od razloga mogao biti, ističu stručnjaci, da je riječ o novom modelu rušenja aviona. Prihvatanje odgovornosti moglo bi dati potreban mig istražiteljima u kojem smjeru trebaju krenuti te bi se onemogućilo da se na sličan način izvede još napada – kao primjer uzimaju pokušaje da se avion sruši eksplozivom u cipeli ili u donjem vešu. Oba su slučaja propala, ali stručnjaci tvrde da bi ih bilo gotovo nemoguće otkriti nakon nesreće. Potraga za ostacima aviona se nastavlja, a Egipat je poslao i podmornicu da se pronađu crne kutije.
