Program praćenja kvaliteta mora sprovodi se više od 20 godina, a po broju tačaka za ispitivanje Hrvatska je u samom vrhu evropskih zemalja – na 3. mjestu.
Osnovni ciljevi tog programa su zaštita zdravlja kupača, upravljanje plažama u svrhu očuvanja njihovih prirodnih vrijednosti i održive upotrebe, praćenje izgradnje kanalizacijskih sistema i funkcionisanje postojećih, utvrđivanje izvora onečišćenja i njihove sanacije, objavljivanje rezultata kvaliteta mora u svrhu turističke promocije, kao i informisanje javnosti.
Prilikom uzorkovanja prate se i meteorološki uslovi, temperatura i slanost mora, kao i vidljivo onečišćenje.
U sezoni 2012. ispitivanje je u Hrvatskoj obavljeno na 912 tačaka, 779 plaža, odnosno 8.840 uzoraka. Ocjenom odlično i dobro ocijenjeno je 98,03 odsto uzoraka, zadovoljavajuće 1,21 odsto, dok je nezadovoljavajućim proglašeno 0,77 odsto uzoraka.
Prema prošlogodišnjem izvještaju Evropske agencije za zaštitu okoline, more u Hrvatskoj, uz Vajar i Maltu, najbolje je ocijenjeno u Evropi.